Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm9972E9Q053 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm9972E9Q053 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm9972E9Q053 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms