Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ryr1E9PZQ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ryr1E9PZQ0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ryr1E9PZQ0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ryr1E9PZQ0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ryr1E9PZQ0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ryr1E9PZQ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ryr1E9PZQ0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ryr1E9PZQ0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ryr1E9PZQ0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ryr1E9PZQ0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ryr1E9PZQ0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ryr1E9PZQ0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ryr1E9PZQ0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ryr1E9PZQ0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ryr1E9PZQ0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ryr1E9PZQ0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms