Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sfta2E9PXB6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms