Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Soga1E1U8D0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Soga1E1U8D0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Soga1E1U8D0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Soga1E1U8D0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms