Protein–RNA interactions for Protein: B9EJU1

Gm1141, Gene model 1141, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1141B9EJU1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm1141B9EJU1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1141B9EJU1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm1141B9EJU1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1141B9EJU1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1141B9EJU1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1141B9EJU1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1141B9EJU1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm1141B9EJU1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm1141B9EJU1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm1141B9EJU1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm1141B9EJU1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm1141B9EJU1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm1141B9EJU1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm1141B9EJU1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm1141B9EJU1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm1141B9EJU1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms