Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf3B2RQG2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Phf3B2RQG2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf3B2RQG2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.9 ms