Protein–RNA interactions for Protein: B0QZF7

Proca1, Protein PROCA1, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proca1B0QZF7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Proca1B0QZF7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Proca1B0QZF7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Proca1B0QZF7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Proca1B0QZF7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Proca1B0QZF7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Proca1B0QZF7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Proca1B0QZF7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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