Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pm20d2A3KG59 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pm20d2A3KG59 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pm20d2A3KG59 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms