Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyb561d1A2AE42 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyb561d1A2AE42 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyb561d1A2AE42 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyb561d1A2AE42 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyb561d1A2AE42 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyb561d1A2AE42 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyb561d1A2AE42 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyb561d1A2AE42 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyb561d1A2AE42 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyb561d1A2AE42 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cyb561d1A2AE42 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cyb561d1A2AE42 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyb561d1A2AE42 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms