Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIW3

Frmpd3, FERM and PDZ domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd3A0A140LIW3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmpd3A0A140LIW3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmpd3A0A140LIW3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmpd3A0A140LIW3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmpd3A0A140LIW3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmpd3A0A140LIW3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmpd3A0A140LIW3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Frmpd3A0A140LIW3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd3A0A140LIW3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd3A0A140LIW3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd3A0A140LIW3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd3A0A140LIW3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Frmpd3A0A140LIW3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Frmpd3A0A140LIW3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Frmpd3A0A140LIW3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Frmpd3A0A140LIW3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms