Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema6cQ9WTM3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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