Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChmlQ9QZD5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms