Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Mrpl39Q9JKF7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms