Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc83Q9D4V3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc83Q9D4V3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms