Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim68Q8K243 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trim68Q8K243 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trim68Q8K243 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim68Q8K243 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms