Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SobpQ0P5V2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SobpQ0P5V2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms