Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms