Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd1P33215 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms