Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RxraP28700 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RxraP28700 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RxraP28700 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
RxraP28700 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
RxraP28700 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RxraP28700 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RxraP28700 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RxraP28700 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RxraP28700 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RxraP28700 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RxraP28700 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RxraP28700 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms