Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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