Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn6Q9Z262 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms