Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gpc6Q9R087 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gpc6Q9R087 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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