Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ap3m1Q9JKC8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ap3m1Q9JKC8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms