Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
OtofQ9ESF1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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