Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Eci3Q78JN3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Eci3Q78JN3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Eci3Q78JN3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Eci3Q78JN3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Eci3Q78JN3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Eci3Q78JN3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Eci3Q78JN3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Eci3Q78JN3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Eci3Q78JN3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Eci3Q78JN3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Eci3Q78JN3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Eci3Q78JN3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Eci3Q78JN3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Eci3Q78JN3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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