Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp49Q6P9L4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp49Q6P9L4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp49Q6P9L4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp49Q6P9L4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp49Q6P9L4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp49Q6P9L4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp49Q6P9L4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp49Q6P9L4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp49Q6P9L4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp49Q6P9L4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp49Q6P9L4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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