Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CEP170Q5SW79 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CEP170Q5SW79 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms