Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.7 ms