Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nbr1P97432 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms