Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms