Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjc1P28229 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gjc1P28229 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjc1P28229 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjc1P28229 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjc1P28229 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gjc1P28229 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjc1P28229 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjc1P28229 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gjc1P28229 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjc1P28229 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gjc1P28229 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjc1P28229 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms