Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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