Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF22A3QJZ6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF22A3QJZ6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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