Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tnfsf18Q7TS55 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms