Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms