Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samhd1Q60710 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms