Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSME1Q06323 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSME1Q06323 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms