Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zfp39Q02525 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms