Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec23aQ01405 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms