Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hoxd13P70217 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hoxd13P70217 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hoxd13P70217 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hoxd13P70217 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Hoxd13P70217 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd13P70217 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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