Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HccsP53702 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HccsP53702 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HccsP53702 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HccsP53702 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HccsP53702 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HccsP53702 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HccsP53702 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HccsP53702 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HccsP53702 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HccsP53702 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HccsP53702 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HccsP53702 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HccsP53702 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HccsP53702 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HccsP53702 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HccsP53702 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HccsP53702 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HccsP53702 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HccsP53702 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HccsP53702 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HccsP53702 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HccsP53702 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HccsP53702 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HccsP53702 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms