Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCGF2P35227 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms