Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrm1P12657 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms