Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CatspereP0DP43 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms