Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Fam240aJ3QNP9 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Fam240aJ3QNP9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Fam240aJ3QNP9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Fam240aJ3QNP9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Fam240aJ3QNP9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Fam240aJ3QNP9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Fam240aJ3QNP9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Fam240aJ3QNP9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Fam240aJ3QNP9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Fam240aJ3QNP9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Fam240aJ3QNP9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam240aJ3QNP9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Fam240aJ3QNP9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Fam240aJ3QNP9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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