Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp408H7BX78 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms