Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Zfp946F6VWU8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zfp946F6VWU8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms