Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssxb8B1AY40 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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