Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trpc2Q9R244 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms