Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Wdr61Q9ERF3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Wdr61Q9ERF3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms